Por María Fernanda Ziegler
publicado n/a Agencia FAPESP
Los investigadores identificarán material genético con valor pronóstico capaz de predecir la supervivencia de pacientes con determinados tipos de cáncer de mama. También reveló una mejor comprensión de los mecanismos moleculares de un proceso de vascularización llamado angiogénesis patológica, esencial para el desarrollo de diversas actividades.
a la investigación, publicado en una revista Genética PLOS, estudios combinados de los genes implicados en la retinopatía patológica (daño ocular que también sirve como modelo para estudios de angiogénesis) y datos de expresión génica (trancripcionoma) de bases de datos públicas de cáncer de mama.
Realizado por investigadores del Instituto de Química de la Universidad de São Paulo (IQ-USP) en colaboración con el Instituto de Investigación del Cáncer de Ontario (IORC), no Canadá, o estudiado con Soporte FAPESP.
“Hemos identificado un conjunto de genes cuya expresión en el cáncer de mama se correlaciona con el grado de vascularización patológica (angiogénesis) del tumor. Esta es, por tanto, una hipótesis genética para la angiogénesis pronóstica y más robusta que las hipótesis previamente identificadas, dada la correlación existente entre la angiogénesis y los tumores en general”, dijo. Ricardo Giordano , profesor del IQ-USP y autor del estudio.
Ningún estudio, investigadores brasileños identificaron 153 genes alterados entre retinas normales y retinas patológicas en camundongos. De esta lista de foraminíferos, identificamos 149 genes humanos equivalentes. El resultado sirvió de base para la investigación sobre genética, con la asociación del grupo canadiense. Para este grupo, utilicé una base de datos que contenía información sobre pacientes con cáncer de mama. En total, 11 genes clave implicados en foraminíferos de angiogénesis patológica que funcionan mejor para un sujeto de pronóstico.
Cáncer de mama y retinopatía común o proceso angiogénico. «El hecho de que estas dos doenças compartan este proceso y que la angiogénesis sea fundamental para el desarrollo de los cánceres nos llevó a tratar de cerrar la brecha entre la retinopatía y el cáncer de mama», dijo. Joao Carlos Setúbal , coordinador del posgrado interunidades en bioinformática de la USP, también autor del artículo.
Según los investigadores, la razón por la cual el estudio fue específicamente diagnosticado con cáncer de mama es la disponibilidad de datos de la doença. “Necesitamos acceso a grandes cantidades de datos públicos, porque hay mucha variación de persona a persona. Y específicamente para el cáncer de mama, había un conjunto de datos disponible para nuestro estudio, con información de 2000 pacientes”, dijo Setubal.
Según Setubal, detectar la asignación requirió realizar un sofisticado proceso computacional, dos datos generados en el laboratorio, un campo conocido como bioinformática. Otro trabajo se ha desarrollado en asociación con investigadores canadienses de la OICR. o estudiante de doctorado Rodrigo Guarischi de Sousa , también autor del estudio, creación o programa que probó los 149 genes humanos como posibles componentes del curso para pacientes con cáncer. Esta parte del estudio fue realizada por meio de bolsa de estación de investigación no exterior apoyado por la FAPESP, bajo la coordinación de Paul C. Boutros, no por la OICR.
Boutros es actualmente investigador en el Departamento de Genética Humana de la Universidad de California, Los Ángeles (UCLA), y Guarischi de Sousa se formó y trabajó en la empresa Dasa en São Paulo.
A partir de este encargo, los investigadores pretenden encontrar aplicaciones, especialmente en terapias contra el cáncer de mama. “Nuestro objetivo ahora es continuar con el estudio de la angiogénesis en el cáncer. Estamos interesados en identificar genes esenciales que puedan ser útiles para el desarrollo de nuevos medicamentos o para la reutilización de medicamentos existentes”, dice Giordano.
Dar retinopatía o cáncer de mama
El descubrimiento de la hipótesis pronóstica del cáncer de mama es el resultado de un largo estudio iniciado en 2010, a través de una bolsa de investigación del Consejo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico (CNPq), cuando Giordano inició estudios sobre el transcriptoma (datos referentes a expresa genes) y el proteoma (proteínas) de la retina angiogénica.
“A raíz de este estudio, implantamos un modelo no de laboratorio en camundongos para el estudio de la retinopatía. El modelo en los mundos es importante porque es difícil estudiar la formación de vasos sanguíneos fuera del tejido vivo. Por lo tanto, solo este modelo permite inducir y estudiar la retinopatía en el laboratorio, modulando el nivel de oxígeno, y realizar estudios relacionados con la angiogénesis”, explica Giordano.
Con base en los dos ejemplos, los investigadores pueden estudiar las diferencias entre la formación de vasos en condiciones fisiológicas (que ocurren normalmente) y en condiciones patológicas. “Comprobamos qué genes expresaban las células endoteliales (que recubren los vasos sanguíneos) en diferentes condiciones, buscando siempre los genes más expresados en una condición diferente a otra o viceversa”, dice Giordano.
Un elemento esencial que no sentí fue la variación de oxígeno en las habitaciones donde estábamos los camundongos recién nacidos. En las cámaras de oxígeno al 75%, los camundongos presentaban retinopatía, aunque en ausencia del ambiente (20% de oxígeno), la retina se desarrollaba con normalidad. El descubrimiento de dos mecanismos que permiten a las células detectar la presencia de oxígeno fue el tema del Premio Nobel de Medicina de 2019, que se otorgó a los investigadores William G. Kaelin Jr., Peter J. Ratcliffe y Gregg L. Semenza.
Assinatura de pronóstico referente a los genes expresados
Es importante destacar que la asignación del gen para la angiogénesis puede tener una posibilidad de aplicación clínica muy diferente a la del gen marcador. BRCA1. Gene O – assim como o BRCA2 – Fue mundialmente famoso en 2013, cuando la actriz estadounidense Angelina Jolie se sometió a dos mastectomías luego de haber descubierto, a partir de una prueba, mutaciones específicas de este gen, lo que indicaba que tendría un 87% de riesgo de desarrollar cáncer de mama.
«DONDE BRCA1 Es un gen en el genoma. Una mujer con mutaciones genéticas tiene mayor riesgo de desarrollarlo, ya que no necesariamente desarrollará cáncer de mama. Por tanto, la presencia del gen con mutaciones ayuda a predecir la aparición de la enfermedad. El curso de nuestro estudio se ha mostrado prometedor al anticipar el desarrollo de la obra después de su aparición de facto”, dijo Setubal.
o artículo Una firma basada en transcriptomas de angiogénesis patológica predice la supervivencia en pacientes con cáncer de mama. (doi:10.1371/journal.pgen.1008482), por Rodrigo Guarischi-Sousa, Jhonatas S. Monteiro, Lilian C. Alecrim, Jussara S. Michalolski, Laura B. Cardeal, Elisa N. Ferreira, Dirce M. Carraro, Diana N Nunes, Emmanuel Dias-Neto, Juri Reimand, Paul C. Boutros, João C. Setubal y Ricardo J. Giordano, pueden ser lido aquí.